$ od -c -N 50000 [phylum]<CTamarin>Doc>Notes>loops.tedit!1
0000000    P   R   O   P   O   S   E   D       T   A   M   A   R   I   N
0000020        O   P   C   O   D   E   S       F   O   R       C   O   M
0000040    M   O   N       L   O   O   P   S  \r  \r  \r   P   e   r   m
0000060    u   t   a   t   i   o   n       V   e   c   t   o   r  \r  \r
0000100   \t   T   h   i   s       i   s       a       v   e   c   t   o
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0001600    d   o       y   o   u       n   o   t       k   n   o   w    
0001620    t   h   e       #       s   l   o   t   s       a       c   l
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0002360        N   o   r   m   a   l       f   u   n   c   t   i   o   n
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0002660    s   s   )  \r  \r  \t   T   h   i   s       o   p   c   o   d
0002700    e       i   s       u   s   e   d       t   o       a   c   c
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0002760    o   f       a   n       i   n   s   t   a   n   c   e   .    
0003000        T   h   e       o   p   e   r   a   n   d   s       f   o
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0003040    :  \r  \t  \r  \t   T   o   s  \t   -       P   t   r       t
0003060    o       t   h   e       i   n   s   t   a   n   c   e  \r  \t
0003100    I   B   u   f   N  \t   -       S   l   o   t       n   u   m
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0003340    o   m       a   n       i   n   s   t   a   n   c   e   .    
0003360        T   h   e       p   e   r   m   u   t   a   t   i   o   n
0003400        v   e   c   t   o   r       m   u   s   t       b   e    
0003420    a   c   c   e   s   s   e   d       t   o       f   i   n   d
0003440        t   h   e       c   o   r   r   e   c   t       o   f   f
0003460    s   e   t       i   n   t   o       t   h   e       i   n   s
0003500    t   a   n   c   e       s   l   o   t   s       o   f       t
0003520    h   e       d   e   s   i   r   e   d       i   t   e   m   .
0003540            T   h   e       r   e   s   u   l   t   i   n   g    
0003560    s   l   o   t       v   a   l   u   e       i   s       t   h
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0003620    .           T   h   e       s   t   e   p   s       t   h   e
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0003660    e       a   r   e   :  \r  \r  \t   -       A   r   g       _
0003700        R   e   a   d   M   e   m   o   r   y   [   P   V       +
0003720        I   B   u   f   N   ]      \t   T   h   i   s       g   e
0003740    t   s       s   l   o   t       d   i   s   p   l   a   c   e
0003760    m   e   n   t  \r  \r  \t   -       T   e   m   p       _    
0004000    R   e   a   d   M   e   m   o   r   y   [   T   o   s       +
0004020        n   ]  \t  \t   T   h   i   s       g   e   t   s       a
0004040    d   d   r   e   s   s       o   f       s   l   o   t   s  \r
0004060   \r  \t   -       T   o   s       _       R   e   a   d   M   e
0004100    m   o   r   y   [   T   e   m   p       +       A   r   g   ]
0004120   \t  \t   T   h   i   s       r   e   a   d   s       t   h   e
0004140        s   l   o   t  \r  \t  \r   T   h   i   s       o   p   c
0004160    o   d   e       m   u   s   t       U   f   n       i   f    
0004200    t   h   e       P   V       e   n   t   r   y       i   s    
0004220    N   i   l   ,       s   o       t   h   a   t       t   h   e
0004240        P   V       c   a   n       b   e       r   e   b   u   i
0004260    l   t       a   n   d       d   e   p   o   s   i   t   e   d
0004300        i   n       t   h   e       s   p   e   c   i   a   l    
0004320    l   o   c   a   t   i   o   n   .  \r  \r   -       I   f    
0004340    t   h   e       s   l   o   t       a   d   d   r   e   s   s
0004360        i   s       c   a   c   h   e   d       i   n       t   h
0004400    e       s   t   a   c   k       f   r   a   m   e       t   h
0004420    e       e   x   t   r   a       m   e   m   o   r   y       r
0004440    e   f   e   r   e   n   c   e       c   a   n       b   e    
0004460    a   v   o   i   d   e   d   ,       b   u   t       a       m
0004500    i   c   r   o   i   n   s   t   r   u   c   t   i   o   n    
0004520    t   o       a   c   c   e   s   s       t   h   e       c   a
0004540    c   h   e       l   o   c   a   t   i   o   n       m   a   y
0004560        s   t   i   l   l       b   e       n   e   c   e   s   s
0004600    a   r   y   ,       u   n   l   e   s   s       t   h   e    
0004620    s   l   o   t       a   d   d   r   e   s   s       w   a   s
0004640        i   n       a       f   i   x   e   d       c   a   c   h
0004660    e       l   o   c   a   t   i   o   n   .  \r  \r  \t   b   .
0004700            C   o   m   p   l   e   x       P   V       (   s   e
0004720    v   e   r   a   l       c   l   a   s   s   e   s   )  \r  \r
0004740   \t   T   h   i   s       o   p   e   r   a   t   i   o   n    
0004760    r   e   q   u   i   r   e   s       s   e   v   e   r   a   l
0005000        o   p   c   o   d   e   s   .           T   h   e   y    
0005020    a   r   e       u   s   e   d       t   o       a   c   c   e
0005040    s   s       d   a   t   a       c   o   n   t   a   i   n   e
0005060    d       i   n       t   h   e       s   l   o   t   s       o
0005100    f       a   n       i   n   s   t   a   n   c   e       w   h
0005120    e   n       t   h   e   r   e       i   s       m   o   r   e
0005140        t   h   a   n       o   n   e       c   l   a   s   s    
0005160        i   n   p   u   t       t   o       a       m   e   t   h
0005200    o   d   .           T   h   e   y       a   r   e       s   p
0005220    l   i   t       i   n   t   o       t   w   o       o   p   c
0005240    o   d   e   s       s   o       t   h   a   t       t   h   e
0005260        t   w   o       I   B   u   f   N       c   o   n   s   t
0005300    a   n   t   s       c   a   n       b   e       p   a   r   t
0005320        o   f       e   a   c   h       o   p   c   o   d   e    
0005340    t   h   u   s       g   i   v   i   n   g       t   h   e    
0005360    m   i   c   r   o   c   o   d   e       f   a   s   t   e   r
0005400        a   c   c   e   s   s       t   o       t   h   e   m   .
0005420            T   h   e       f   i   r   s   t       o   p   c   o
0005440    d   e       m   u   s   t       d   e   t   e   r   m   i   n
0005460    e       t   h   e       c   o   r   r   e   c   t       P   V
0005500        e   n   t   r   y   .           T   h   e       o   p   e
0005520    r   a   n   d   s       f   o   r       t   h   i   s       o
0005540    p   c   o   d   e       a   r   e   :  \r  \r  \t   T   o   s
0005560   \t   -       p   t   r       t   o       t   h   e       i   n
0005600    s   t   a   n   c   e  \r  \t   I   B   u   f   N  \t   -    
0005620    P   o   s   i   t   i   o   n       o   f       d   e   s   i
0005640    r   e   d       P   V  \r  \t   P   V  \t   -       P   t   r
0005660        t   o       P   e   r   m   u   t   a   t   i   o   n    
0005700    v   e   c   t   o   r       i   n       t   h   e       r   e
0005720    s   e   r   v   e   d       c   e   l   l  \r  \r  \t   -    
0005740    T   o   s   +   1       _       R   e   a   d   M   e   m   o
0005760    r   y   [   P   V       +       I   B   u   f   N   ]  \t   G
0006000    e   t       P   V       f   o   r       d   e   s   i   r   e
0006020    d       c   l   a   s   s  \r  \r   w   i   t   h       t   h
0006040    e       r   e   s   u   l   t   i   n   g       P   V       b
0006060    e   i   n   g       p   u   s   h   e   d       o   n   t   o
0006100        t   h   e       s   t   a   c   k   .           T   h   i
0006120    s       o   p   c   o   d   e       m   u   s   t       U   f
0006140    n       i   f       t   h   e       P   V       e   n   t   r
0006160    y       i   s       N   i   l   ,       s   o       t   h   a
0006200    t       t   h   e       P   V       e   n   t   r   y       c
0006220    a   n       b   e       r   e   b   u   i   l   t   .      \r
0006240   \r   -       W   h   a   t       i   s       n   e   e   d   e
0006260    d       t   o       r   e   b   u   i   l   d       t   h   e
0006300        P   V   ?           I   f       i   s       i   s       a
0006320        c   o   m   p   l   e   x       P   V       t   h   e   n
0006340        m   o   r   e       t   h   a   n       a   n       i   n
0006360    s   t   a   n   c   e       s   h   o   u   l   d       b   e
0006400        r   e   q   u   i   r   e   d       (   i   .   e   .    
0006420    a   l   l       t   h   e       c   l   a   s   s   e   s    
0006440    u   s   e   d       i   n       t   h   e       m   e   t   h
0006460    o   d   )   .      \r  \r   T   h   e       n   e   x   t    
0006500    o   p   c   o   d   e       a   c   c   e   s   s   e   s    
0006520    a       s   l   o   t       b   a   s   e   d       o   n    
0006540    t   h   e       P   V       a   t       T   o   s   .       I
0006560    t   s       o   p   e   r   a   n   d   s       a   r   e   :
0006600   \r  \r  \t   T   o   s   -   1  \t   -       p   t   r       t
0006620    o       t   h   e       i   n   s   t   a   n   c   e  \r  \t
0006640    T   o   s  \t   -       p   t   r       t   o       t   h   e
0006660        P   V  \r  \t   I   B   u   f   N  \t   -       S   l   o
0006700    t       n   u   m   b   e   r       t   o       a   c   c   e
0006720    s   s  \r  \r   w   i   t   h       t   h   e       P   V    
0006740    b   e   i   n   g       p   o   p   p   e   d       f   r   o
0006760    m       t   h   e       s   t   a   c   k       a   n   d    
0007000    t   h   e   n       t   h   e       s   l   o   t       p   l
0007020    a   c   e   d       a   t       t   h   e       n   e   w    
0007040    T   o   s   .           T   h   e       s   t   e   p   s    
0007060    f   o   r       t   h   i   s       o   p   c   o   d   e    
0007100    w   o   u   l   d       b   e   :      \r  \r  \t   -       A
0007120    r   g       _       R   e   a   d   M   e   m   o   r   y   [
0007140    T   o   s       +       I   B   u   f   N   ]  \r  \r  \t   -
0007160        T   e   m   p       _       R   e   a   d   M   e   m   o
0007200    r   y   [   T   o   s   -   1       +       n   ]  \r  \r  \t
0007220    -       T   o   s       _       T   o   s       -       1  \r
0007240   \r  \t   -       T   o   s       _       R   e   a   d   M   e
0007260    m   o   r   y   [   T   e   m   p       +       A   r   g   ]
0007300   \r  \r  \r   I   I   .  \t   M   e   t   h   o   d       C   a
0007320    l   l  \r  \r  \t   A       m   e   t   h   o   d       c   a
0007340    l   l       p   e   r   f   o   r   m   s       a       m   e
0007360    t   h   o   d       l   o   o   k   u   p       b   a   s   e
0007400    d       o   n       t   h   e       c   l   a   s   s       o
0007420    r       c   l   a   s   s   e   s       o   f       o   n   e
0007440        o   r       m   o   r   e       o   f       t   h   e    
0007460    p   a   r   a   m   e   t   e   r   s   .           T   h   e
0007500        s   i   m   p   l   e       m   e   t   h   o   d       c
0007520    a   l   l       w   i   l   l       p   e   r   f   o   r   m
0007540        t   h   e       l   o   o   k   u   p       o   n   l   y
0007560        f   o   r       o   n   e       c   l   a   s   s   ,    
0007600    w   h   e   n       i   t       i   s       t   h   e       f
0007620    i   r   s   t       p   a   r   a   m   e   t   e   r   .    
0007640        A       m   e   t   h   o   d       c   a   l   l       i
0007660    s       i   n   v   o   k   e   d       t   h   r   o   u   g
0007700    h       t   h   e       n   o   r   m   a   l       f   u   n
0007720    c   t   i   o   n       c   a   l   l       m   e   c   h   a
0007740    n   i   s   m       w   i   t   h       t   h   e       d   e
0007760    f   i   n   i   t   i   o   n       c   e   l   l       o   f
0010000        t   h   e       c   a   l   l   e   d       i   t   e   m
0010020        b   e   i   n   g       a       s   p   e   c   i   a   l
0010040        m   e   t   h   o   d       s   u   b   t   y   p   e   .
0010060        T   h   e       m   i   c   r   o   c   o   d   e       w
0010100    i   l   l       t   h   e   n       h   a   v   e       t   o
0010120        p   e   r   f   o   r   m       t   h   e       f   o   l
0010140    l   o   w   i   n   g   :  \r  \r  \t   F   i   r   s   t    
0010160    t   h   e       w   r   a   p   p   e   r       f   o   r    
0010200    t   h   e       1   s   t       p   a   r   a   m   e   t   e
0010220    r       m   u   s   t       b   e       f   o   u   n   d   .
0010240            T   h   i   s       w   i   l   l       b   e       p
0010260    e   r   f   o   r   m   e   d       b   y       i   n   d   e
0010300    x   i   n   g       i   n   t   o       a       t   y   p   e
0010320        t   a   b   l   e       b   a   s   e   d       o   n    
0010340    t   h   e       t   y   p   e       b   i   t   s       o   f
0010360        t   h   e       p   a   r   a   m   e   t   e   r   ,    
0010400    u   n   l   e   s   s       t   h   e       p   a   r   a   m
0010420    e   t   e   r       i   s       a   n       i   n   s   t   a
0010440    n   c   e   ,       i   n       w   h   i   c   h       c   a
0010460    s   e       t   h   e       a   c   t   u   a   l       w   r
0010500    a   p   p   e   r       f   o   r       t   h   e       i   n
0010520    s   t   a   n   c   e       w   i   l   l       b   e       u
0010540    s   e   d   .          \r  \r  \t   O   n   c   e       t   h
0010560    e       w   r   a   p   p   e   r       i   s       f   o   u
0010600    n   d       t   h   e       m   e   t   h   o   d       l   o
0010620    o   k   u   p       i   s       p   e   r   f   o   r   m   e
0010640    d   .           T   h   i   s       o   c   c   u   r   s    
0010660    b   y       t   a   k   i   n   g       t   h   e       w   r
0010700    a   p   p   e   r       a   n   d       c   o   m   a   p   r
0010720    i   n   g       i   t       w   i   t   h       t   h   e    
0010740    w   r   a   p   p   e   r   s       i   n       t   h   e    
0010760    l   o   o   k   u   p       t   a   b   l   e       o   f    
0011000    t   h   e       m   e   t   h   o   d   s   .           I   t
0011020        w   i   l   l       e   i   t   h   e   r       b   e    
0011040    a       s   i   m   p   l   e       h   a   s   h       t   a
0011060    b   l   e       o   f       a   b   o   u   t       1   6    
0011100    e   n   t   i   e   s   ,       o   r       a       s   t   r
0011120    a   i   g   h   t       l   i   n   e   a   r       s   e   a
0011140    r   c   h       t   h   r   o   u   g   h       a       t   a
0011160    b   l   e   .           T   h   e       t   a   b   l   e    
0011200    w   i   l   l       b   e       f   o   u   n   d       t   h
0011220    r   o   u   g   h       a   n       e   n   t   r   y       i
0011240    n       t   h   e       m   e   t   h   o   d       o   b   j
0011260    e   c   t   .  \r  \r  \t   I   f       a       m   a   t   c
0011300    h       i   s       f   o   u   n   d       t   h   e       c
0011320    o   r   r   e   s   p   o   n   d   i   n   g       f   u   n
0011340    c   t   i   o   n       i   s       i   n   v   o   k   e   d
0011360        w   i   t   h       a       n   o   r   m   a   l       f
0011400    u   n   c   t   i   o   n       c   a   l   l   ,       w   i
0011420    t   h       t   h   e       e   x   c   e   p   t   i   o   n
0011440        t   h   a   t       t   h   e       p   e   r   m   u   t
0011460    a   t   i   o   n       v   e   c   t   o   r       f   o   r
0011500        t   h   e       m   e   t   h   o   d       i   s       s
0011520    e   t       t   o       t   h   e       P   V           i   n
0011540    d   i   c   a   t   e   d       i   n       t   h   e       f
0011560    u   n   c   t   i   o   n       h   e   a   d   e   r       o
0011600    f       t   h   e       m   e   t   h   o   d   .  \r  \r  \t
0011620    T   h   e       m   e   t   h   o   d       U   f   n       r
0011640    o   u   t   i   n   e       i   s       i   n   v   o   k   e
0011660    d       i   f       a       m   a   t   c   h       i   s    
0011700    n   o   t       f   o   u   n   d       f   o   r       t   h
0011720    e       w   r   a   p   p   e   r   ,       w   h   e   r   e
0011740        o   t   h   e   r       m   e   t   h   o   d   s       m
0011760    a   y       b   e       s   e   a   r   c   h   e   d   .  \r
0012000   \r  \r   -       I   f       m   o   r   e       t   h   a   n
0012020        o   n   e       c   l   a   s   s       i   s       d   e
0012040    s   i   r   e   d   ,       c   o   u   l   d       w   e    
0012060    x   o   r       t   h   e       w   r   a   p   p   e   r   s
0012100        &       u   s   e       t   h   a   t       f   o   r    
0012120    a       h   a   s   h       l   o   o   k   u   p   ,       t
0012140    h   e   n       c   o   m   p   a   r   e       e   a   c   h
0012160        w   r   a   p   p   e   r   ?           O   r       h   a
0012200    v   e       a       t   r   e   e       s   t   r   u   c   t
0012220    u   r   e   d       l   o   o   k   u   p       w   h   e   r
0012240    e       t   h   e       1   s   t       p   a   r   a   m   e
0012260    t   e   r       m   a   t   c   h       p   o   i   n   t   s
0012300        o   f   f       t   o       t   h   e       2   n   d    
0012320    p   a   r   a   m   e   t   e   r       l   o   o   k   u   p
0012340        t   a   b   l   e       .   .   .       t   i   l   l    
0012360    l   a   s   t       m   a   t   c   h       p   o   i   n   t
0012400    s       o   f   f       t   o       t   h   e       m   e   t
0012420    h   o   d   .  \r  \r  \r  \r   I   I   I   .  \t   C   l   a
0012440    s   s       L   o   o   k   u   p  \r  \r  \t   A   n   o   t
0012460    h   e   r       o   p   c   o   d   e       i   s       d   e
0012500    s   i   r   e   d       t   o       r   e   t   u   r   n    
0012520    t   h   e       c   l   a   s   s       (   w   r   a   p   p
0012540    e   r   )       o   f       a   n       o   b   j   e   c   t
0012560    .           T   h   i   s       o   p   c   o   d   e        
0012600    r   e   t   u   r   n   s       t   h   e       w   r   a   p
0012620    p   e   r       o   f       a   n   y       o   b   j   e   c
0012640    t   .           T   h   e       t   y   p   e       b   i   t
0012660    s       a   r   e       u   s   e   d       t   o       i   n
0012700    d   e   x       i   n   t   o       t   h   e       t   y   p
0012720    e       t   a   b   l   e       a   n   d       t   h   e    
0012740    i   n   d   e   x   e   d       v   a   l   u   e       i   s
0012760        r   e   t   u   r   n   e   d   .           I   f       t
0013000    h   e       v   a   l   u   e       i   s       1   ,       t
0013020    h   e   n       t   h   e       w   r   a   p   p   e   r    
0013040    s   h   o   u   l   d       b   e       f   o   u   n   d    
0013060    a   t       a   n       o   f   f   s   e   t       o   f    
0013100    o   n   e       f   r   o   m       t   h   e       l   o   c
0013120    a   t   i   o   n       p   o   i   n   t   e   d       t   o
0013140        b   y       T   o   s   .       I   f       t   h   e    
0013160    t   y   p   e       t   a   b   l   e       v   a   l   u   e
0013200        i   s       N   I   i   l   ,       t   h   e       o   p
0013220    c   o   d   e       w   i   l   l       t   r   a   p   .    
0013240        T   h   e       c   o   d   e       s   t   e   p   s    
0013260    w   o   u   l   d       b   e       s   o   m   e   t   h   i
0013300    n   g       l   i   k   e   :  \r  \r  \r  \t   -       T   e
0013320    m   p       _       R   e   a   d   M   e   m   o   r   y   [
0013340    T   y   p   e   T   a   b   l   e       +       T   o   s    
0013360    t   y   p   e       b   i   t   s   ]  \r  \r  \t   -       T
0013400    e   m   p       =       0  \r  \r  \t   -       Y   e   s   :
0013420        T   o   s       _       R   e   a   d   M   e   m   o   r
0013440    y   [   T   o   s       +       1   ]  \r  \r  \t   -       N
0013460    o   :           T   e   m   p   1       =       N   i   l  \r
0013500   \r  \t  \t   -       Y   e   s   :       T   r   a   p  \r  \r
0013520   \t  \t   -       N   o   :       T   o   s       _       T   e
0013540    m   p   1  \r  \r  \r  \0  \0  \0  \0  \0 004  \0 002  \0 023
0013560   \0 005   G   A   C   H   A  \0  \n  \0  \0  \0  \0  \0  \0 001
0013600   \0  \0   ?  \0   1   (   D   E   F   A   U   L   T   F   O   N
0013620    T       1       (   G   A   C   H   A       1   0   )       (
0013640    G   A   C   H   A       8   )       (   T   E   R   M   I   N
0013660    A   L       8   )   )  \0  \n  \0  \0  \0  \0  \0  \0  \0  \0
0013700   \0  \0 002 236  \0  \0  \0  \0 002  \0  \0 001   I  \0  \0  \0
0013720   \0 001  \0  \0 004 366  \0  \0  \0  \0 002  \0  \0  \0 337  \0
0013740   \0  \0  \0 001  \0  \0 002 347  \0  \0  \0  \0 002  \0  \0  \0
0013760  221  \0  \0  \0  \0 001  \0  \0 006 320  \0  \0  \0  \0 002  \0
0014000   \0 001 017  \0  \0  \0  \0 001  \0  \0 002   S  \0  \0  \0  \0
0014020  002  \0  \0 027   f  \0  \t   z 272                            
0014031